История Мега 2 происходит в бездне и начинается в момент когда Джеймси Макрейдс обращается за помощью к глубоководному ныряльщику Джонсу Тейлору, настоящему профи, который способен погрузиться в любую впадину, даже самую глубокую. Однако происходит необычное: в Марианской впадине обнаруживается повышенная активность, причина которой не ясна. Вскоре исследователи узнают, почему эту глубоководную бездну также иногда называют «Адской Пастью». Исследовательская группа Тейлора обнаруживает внутри этой мега-бездны доисторических гигантских акул. Но они не единственная угроза, которая таится там и представляет опасность для человечества, потому что в самых отдаленных глубинах данной бездны можно встретить кровожадного хищника — Мега...